Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxg1Q60987 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms