Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms