Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Laptm4aQ60961 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Laptm4aQ60961 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms