Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms