Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms