Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms