Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1F6

Trav5d-4, T cell receptor alpha variable 5D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5d-4Q5R1F6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav5d-4Q5R1F6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms