Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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