Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf2Q5NC05 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttf2Q5NC05 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms