Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf3Q5HZG4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms