Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkaa1Q5EG47 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms