Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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