Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms