Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt2Q5DTW2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms