Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WhammQ571B6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms