Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl6Q505G4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms