Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms