Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms