Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms