Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms