Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr1d1Q3UV55 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms