Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prom2Q3UUY6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prom2Q3UUY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prom2Q3UUY6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prom2Q3UUY6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms