Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhdc9Q3USL1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhdc9Q3USL1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms