Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc190Q3URK1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms