Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxosQ3UL53 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms