Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms