Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms