Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms