Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LbrQ3U9G9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LbrQ3U9G9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms