Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf180Q3U827 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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