Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hvcn1Q3U2S8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms