Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms