Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms