Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms