Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem104Q3TB48 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms