Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Treml4Q3LRV9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Treml4Q3LRV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Treml4Q3LRV9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms