Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms