Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cers3Q1A3B0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cers3Q1A3B0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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