Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam47cQ14BE7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam47cQ14BE7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms