Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne7Q0VE82 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne7Q0VE82 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms