Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem52bQ0VBF2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms