Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms