Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps8Q0P5W1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms