Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms