Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms