Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms