Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrstQ06666 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms