Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top1Q04750 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top1Q04750 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms