Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms