Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms